内容差异、法律效力以及使用对象不同。
1、内容差异：民法典注释本是对民法典中的条文进行解释和说明，旨在帮助读者更好地理解法律规定。而司法解释汇编则是对各级法院在审判实践中适用的司法解释进行汇总和整理，这些司法解释是对法律条文的进一步解释和具体应用。
2、法律效力：民法典注释本只是一种学术性的解读和阐释，不具有法律效力。而司法解释汇编中的内容是具有法律效力的，可以直接应用于审判实践中。
3、使用对象：民法典注释本主要面向普通读者，旨在帮助他们了解法律规定并指导其行为。而司法解释汇编主要面向法官、检察官、律师等法律专业人士，提供实际办案中的参考和应用。
