南京最好的十所大学是南京大学、东南大学、南京理工大学、河海大学、南京师范大学、南京农业大学、南京航空航天大学、陆军工程大学、南京林业大学、南京工业大学。
南京，作为江苏省省会，是全国重要的科研教育基地，毫不夸张地说江苏省最好的高校基本都在南京市境内。南京自古以来就是一座崇文重教的城市，有“天下文枢”、“东南第一学”之称，明清中国一半以上的状元均出自南京江南贡院。
截至2020年，南京各类高等院校66所，全球科研城市20强排名，南京位列全球第8、中国第3。
