南京师范大学研究生专业中，教育科学学院的课程与教学论与教师教育学院课程与教学论的区别是：
教育科学学院的040102课程与教学论，理论性较强。它以教育学理论为基础，结合课程教学，培养具备扎实的教育学理论功底、具有从事教学、科研和管理工作素质的专业人才。
教师教育学院的040102课程与教学论，实践性较强，它以具体的学科为基础，与具体学科紧密结合。因此，它的课程与教学论硕士学位包括中文、数学、英语、物理、化学、生物、政治、历史、地理教育等9个学科方向。
