一、创办时间不同
1、江苏科技大学：创办于1933年。
2、苏州科技大学：创办于1932年。
二、院校代码不同
1、江苏科技大学：院校代码为10289。
2、苏州科技大学：院校代码为10332。
三、学校特色不同
1、江苏科技大学：江苏省重点建设高校；教育部卓越工程师教育培养计划高校；国家国防科技工业局与江苏省人民政府共建高校；江苏省人民政府与中国船舶工业集团公司、中国船舶重工集团公司共建高校。
2、苏州科技大学：卓越工程师教育培养计划；省部共建高校。
参考资料来源：
百度百科-江苏科技大学
百度百科-苏州科技大学
