你好！
就两校的MPA来说，北京师范大学比较好！
原因有二：
1、MPA属于公共管理学科，根据中国学位与研究生教育信息网（教育部学位中心）的学科排名，北京师范大学在该学科排名全国第6，北京理工大学排在第44名之外。
2、北京师范大学是文科类实力很强的综合型大学，北京理工大学是军事、工科类大学。而MPA是文科专业。
综上所述，报考两校MPA应选择
北京师范大学！
个人意见，仅供参考！
